Ekajaya Fast Ferry opera sette tratte tra nove porti in Indonesia, soprattutto Nusa Dua, Gili Trawangan e Senggigi. Dal porto di Nusa Dua: Gili Trawangan, Senggigi, Bangsal, Yellow Bridge (Nusa Lembongan), Gili Air, Nusa Penida e Gili Meno. Dal porto di Gili Trawangan: Senggigi e Padang Bai. Dal porto di Senggigi: Gili Trawangan e Padang Bai. Dal porto di Padang Bai: Gili Trawangan, Bangsal, Yellow Bridge (Nusa Lembongan), Gili Air, Nusa Penida e Gili Meno.