NYC Ferry opera otto tratte tra 25 porti negli Stati Uniti, soprattutto Pier 11 Wall Street, East 34th Street e Rockaway. Dal porto di Pier 11 Wall Street: East 34th Street, East 90th Street, Midtown Manhattan e altri 17 porti. Dal porto di East 34th Street: Pier 11 Wall Street, Governors Island, Bay Ridge, Sunset Park, Brooklyn Bridge Park Pier 6, Corlears Hook e Red Hook Atlantic Basin. Dal porto di Rockaway: Pier 11 Wall Street, East 34th Street, Ferry Point Park e altri sei porti.