Atlânticoline opera sei tratte tra 10 porti in Portogallo, soprattutto Horta, Velas (São Jorge) e Madalena (Pico). Dal porto di Horta: Velas (São Jorge), Madalena (Pico), São Roque (Pico), Praia da Vitória, Angra do Heroísmo, Graciosa e Calheta (São Jorge). Dal porto di Velas (São Jorge): São Roque (Pico). Dal porto di Corvo: Santa Cruz das Flores.