Zamboanga – Jolo (Sulu) (2 h 20, environ trois fois par jour), Zamboanga – Isabela City (Basilan) (1 heure, 12 fois par jour), Zamboanga – Bongao (Tawi-Tawi) (17 heures, cinq fois par semaine), Zamboanga – Lamitan (Basilan) (1 h 15, quatre fois par jour), Zamboanga – Siasi (Sulu) (13 heures, deux fois par semaine) et Lahad Datu – Bongao (Tawi-Tawi) (3 heures, deux fois par semaine).